La brillante et éclectique équipe du NCIS et la police fédérale australienne (AFP) se greffent à une force opérationnelle multinationale pour contrôler la criminalité navale dans la partie de l'océan la plus disputée de la planète.

Jane Tennant, la première femme agent spécial en charge du NCIS Pearl Harbor, et son équipe inébranlable de spécialistes équilibrent le devoir envers la famille et le pays tout en enquêtant sur des crimes à enjeux élevés impliquant des militaires, la sécurité nationale et les mystères de l'île paradisiaque baignée de soleil elle-même .

Les enquêtes de l'équipe du NCIS de Los Angeles spécialisée dans les missions d'infiltration... Le bureau des cas spéciaux basé à Los Angeles est chargé d'appréhender les criminels qui menacent la sécurité de la Nation. Rien n'arrête l'équipe de l'OSP muni de fausses identités, de couverture et de technologies avancées.

Les enquêtes du NCIS dans la Big Easy, une ville de la Nouvelle-Orléans connue pour sa musique, le divertissement et la décadence. Menée par Dwayne Pride, dit "le King", l’équipe se compose de Christopher LaSalle, un agent spécial qui travaille très dur, mais aussi de la charismatique Meredith Brody, transférée depuis peu, et à la recherche d’un nouveau départ. Pour les aider, le Dr Loretta Wade, aussi excentrique qu’intelligente, intervient en tant que médecin légiste. Cette ville haute en couleurs, abrite également un côté sombre …

À la tête de cette équipe du NCIS, qui opère en dehors de la chaîne de commandement militaire, l'agent Special Leroy Jethro Gibbs, un enquêteur qualifié dont les qualités sont d'être intelligent, solide et prêt à contourner les règles pour faire le travail. Travaillant sous les ordres de Gibbs, on retrouve l'agent Anthony DiNozzo, l'agent Abby Sciuto et le Dr Donald "Ducky" Mallard. De meurtre en espionnage anti-terrorisme et sous-marins volés, ces agents spéciaux parcourent la planète pour enquêter sur tous les crimes ayant un lien avec Marine ou le Corps de la Marine.