Temperance Brennan est une anthropologue hautement qualifiée qui travaille à l'Institut Jeffersonian. En examinant les squelettes de personnes décédées, elle est capable d'en reconstituer la vie et les circonstances de la mort. De telles capacités n'échappent pas au FBI qui fait appel à ses services dans le cadre d'affaires criminelles lorsque les méthodes traditionnelles d'identification des corps ne donnent rien. Temperance travaille en collaboration avec l'agent spécial Seeley Booth, ancien sniper de l'armée qui se méfie de la science et des scientifiques.

Après la mort du père de l'un d'entre eux, deux chasseurs de monstres globe-trotters retournent vivre dans leur ville d'origine pour s'occuper de leur deux adolescents. Ils doivent alors cacher leur véritable identité et découvrent qu'ils vont avoir de quoi faire dans cet endroit tout sauf idyllique...

Après 10 ans d'absence et un drame personnel, Elliot Stabler réintègre la police de New York dans une nouvelle unité chargée de démanteler de l'intérieur les groupes mafieux de la Grosse Pomme.