Après un accident mortel à bord de la Station spatiale internationale, une astronaute se bat pour retourner sur Terre et découvre que de larges pans de sa vie, y compris sa fille, semblent différents.

Nous sommes en l'an 2035. Les quelques milliers d'habitants qui restent sur notre planète sont contraints de vivre sous terre. La surface du globe est devenue inhabitable à la suite d'un virus ayant décimé 99% de la population. Les survivants mettent tous leurs espoirs dans un voyage à travers le temps pour découvrir les causes de la catastrophe et la prévenir. C'est James Cole, hanté depuis des années par une image incompréhensible, qui est désigné pour cette mission.

Abysses, imagine l'humanité menacée par l'apocalypse à cause de la pollution, avec les océans et ceux qui les peuplent se retournant contre les humains. En très peu de temps, toute vie humaine est en jeu – et le sort de l'ensemble de la population mondiale repose entre les mains d'un petit groupe de scientifiques.