En l’an 2019, le Japon, en pleine ère Shôwa, était sur le point de changer d’ère. Mais dans le ciel, une fissure vers une autre dimension est soudainement apparue : s’y trouve le Japon Authentique, un univers parallèle où l’ordre des choses est inversé et où perdure l’ère Shôwa, avec le maintien du militarisme d’autrefois. Le Japon a ainsi subi une invasion, rendue possible grâce à l’usage d’armes à gaz appelées « Genmu » et d’humanoïdes géants appelés « Garan », qui ont rendu obsolète l’armement actuel. Le gouvernement est rapidement tombé, et l’ère Reiwa n’a ainsi jamais commencé.

En 2018, le Japon est éliminé de la coupe du monde de Football dès les huitièmes de finale.Pour faire face à ce nouvel échec cuisant, l’Union japonaise de football décide de fonder « Blue Lock », un centre de formation rassemblant les 300 meilleurs attaquants lycéens du pays afin d’y repérer l’attaquant ultime.Nous suivons le parcours de Yoichi Isagi, un joueur encore inconnu de tous mais brulant d’envie de devenir le meilleur parmi les meilleurs.Pour tirer son épingle du jeu et survivre à ce véritable Battle Royal Sportif supervisé par le coach Jinpachi Ego, il n’a qu’une solution : abandonner son esprit d’équipe et ne compter que sur lui-même.