Sumireko Ogawa rêvait de devenir romancière, mais elle travaille dans une librairie avec son jeune collègue, Ren Adashino. Mais d’étranges phénomènes se produisent et alors qu’elle cherche à en savoir plus, son envie d’écrire revient. Sumireko découvre qu’elle a le don de déclencher des événements mystiques tandis que Ren cache un sombre secret. Sortiront-ils indemnes de leur enquête ?

Dans un monde en proie à des d’effroyables monstres géants connus sous le nom de kaiju, Kafka Hibino aspire à rejoindre un jour les Forces de Défense pour combattre ces terribles créatures. C’était un rêve qu’il avait avec son amie d’enfance, Mina Ashiro, mais leurs chemins ont pris des directions différentes. Aujourd’hui, Kafka nettoie les rues de leurs encombrants cadavres quand il croise la route de Reno Ichikawa. La détermination de Reno à rejoindre les Forces de Défense pousse Kafka à rejoindre Mina afin de protéger l’humanité.