Après avoir sauvé la vie du président des États-Unis, deux agents du FBI sont nommés à un nouveau poste baptisé « Warehouse 13 », un service qui abrite les objets surnaturels que le gouvernement américain a collectés à travers les siècles. Le duo se voit confier la mission de récupérer d'éventuels nouveaux artefacts susceptibles de mettre en danger des individus.

Après avoir découvert que son père est à la tête de Veritas, dont le but est de rechercher les mystères de l'histoire et de la civilisation, Nikko, avide d'aventures, intègre l'équipe...