Flynn Carson est le bibliothécaire depuis maintenant dix ans. Il doit résoudre des mystères impossibles, retrouver des artefacts très puissants et affronter des forces surnaturelles dont celle de la confrérie du serpent, son principal ennemi. Pour l'aider, la Bibliothèque lui a choisi un gardien, le colonel Eve Baird, militaire à l'OTAN. L'équipe se voit très vite complétée par trois "bibliothécaires en herbe" : Jacob Stone, un génie en histoire et architecture, au QI de 190, Cassandra Cillian, une mathématicienne dotée d'une mémoire photographique qui est atteinte d'une tumeur au cerveau et Ezekiel Jones, un voleur et spécialiste en technologie avancée.

La ravissante professeur d'archéologie Sydney Fox fait le tour du monde à la recherche d'antiquités et de trésors perdus. Avec l'aide de son assistant Nigel et de sa Claudia, la secrétaire, elle affronte de dangereuses aventures à chaque nouveau voyage. Maîtrisant parfaitement les arts martiaux, cette version féminine de Indiana Jones ne recule devant rien.

Après avoir découvert que son père est à la tête de Veritas, dont le but est de rechercher les mystères de l'histoire et de la civilisation, Nikko, avide d'aventures, intègre l'équipe...