Akira Tachibana (17 ans), jadis star de son club d'athlétisme, a dû s'arrêter de courir suite à une blessure. Masami Kondo (45 ans) est le gérant du Jardin, le restaurant familial où Akira travaille. Cette histoire se déroule dans une ville côtière et dépeint les vies d'une jeune fille à un point focal de sa jeunesse et d'un homme à un tournant de sa vie. Chacun désire vivre d'intenses émotions.

L'histoire prend place dans un Japon alternatif ravagé par une sorte de peste faisant rouiller le corps humain. Afin de sauver son grand-père mourant, Bisco Akaboshi décide de partir à la recherche du champignon médicinal légendaire nommé Sabikui qui serait un remède contre la rouille.Pendant son voyage, il fait la rencontre de Miro Nekoyanagi, un médecin qui cherche lui aussi un remède pour sauver sa précieuse sœur rongée par la rouille.Ces deux jeunes hommes vont ainsi partir en voyage pour sauver leurs proches.

Suzuko Homura revient habiter à Ikebukuro, là où elle a grandi. Elle se réjouit de retrouver l'amie qu'elle avait laissée, Chinatsu Morikawa. Mais une fois arrivée dans son lycée, elle a du mal à s'intégrer. Afin de se faire des amies, elle décide d'acheter des cartes du très populaire jeu Wixoss.

Nick était membre d'un groupe d'aventuriers vétérans, aidant ses amis indisciplinés à faire leurs comptes dès qu'il le pouvait. Mais quelle était sa récompense ? Être accusé de détournement de fonds et mis à la porte par le chef qu'il respectait. Très vite, il trouve quelques autres aventuriers blasés et des âmes sœurs, et ensemble, ils forment leur propre groupe invincible !

Combattant n°6 est un homme amélioré travaillant pour l'organisation maléfique Kisaragi !Un jour, ses deux supérieures lui confient une mission bien spéciale : explorer et conquérir un nouveau monde au nom de l'organisation. Il ne dispose alors que de quelques outils et d'une androïde nommée Alice, dotée d'un sale caractère.Dans ce nouveau monde assez proche d'un monde médiéval fantastique, Combattant n°6 devient par la force des choses commandant d'une troupe assez atypique composée d'Alice l'androïde hautaine, d'une chimère timide, d'une prêtresse obscure narcoleptique, et de l'ancienne commandante déchue et colérique souhaitant tuer n°6.

Dans un monde où animaux de toutes sortes coexistent, un gentil loup découvre ses pulsions de prédateur alors même qu'un meurtre vient d'être commis dans son école.