Tout au long de la malédiction du triangle des Bermudes, l'équipe enquête sur une variété de mystères et tente de déterminer si ces histoires d'incidents étranges sont purement une coïncidence, ou s'il y a une explication - scientifique ou surnaturelle - cachée sous la surface.

Quatorze ans après la catastrophe nommée "Hammer of Eden" (Marteau du Paradis) qui a engloutit 90% des terres et tué 6 milliards d'êtres humains, les hommes ont fondés les Nouvelles Nations Unies. Aoi, la secrétaire générale des ces Nations Unies demande aux dirigeants des pays une coopération universelle.A Yabitsu, Keel, un jeune garçon turbulent parle avec son amie Isla, une jeune femme enceinte, quand tout-à-coup, un sous-marin nucléaire, l'Ulysse, commandé par Gould, déçu par la race humaine, déclare la guerre aux Nouvelles Nations Unies et attaque la ville.Alors qu'on ordonne l'évacuation, Isla a des contractions. Un jeune homme, Teen, portant l'uniforme des membres de l'Ulysse, aide à l'accouchement et leur donne son insigne pour leur permettre de s'enfuir.

Recca Hanabishi, un jeune garçon pouvant contrôler les flammes, protège Yanagi, sa “princesse” comme il l’appelle. Celle-ci possède en effet un pouvoir qui attise les convoitises : un pouvoir de guérison. Et Koran Mori fait partie de ceux qui rêvent de l’exploiter. Pour cela, il n’hésite pas à utiliser Kurei, le maître des flammes maudit et demi-frère de Recca ! Un combat titanesque va opposer les deux frères et leurs coéquipiers avec comme enjeu, le destin de la planète !

Dans la ville de Sugomori vit Katsuhira Akata, un lycéen qui vient d'apprendre qu'il a été sélectionné pour le programme Kizuna qui permet, à ceux qui y sont connectés, de partager et répartir leurs blessures et douleurs entre eux. Si ce programme a pour but de d'instaurer la paix dans le monde, il est malheureusement encore incomplet. Mais contrairement aux autres, Katsuhira possède une personnalité plutôt plate et ne ressent pas les émotions de la même façon...

A Merced, en Californie, quinze minutes plus tard, une lycéenne déclenche une série d'événements inattendus qui mettent soudainement toute sa vie en danger lorsqu'elle commence à douter qu'elle est humaine.