L'histoire se déroule à "Kyokutō Hōreigai Tokubetsu Chiku" (Far East Special District Outside of the Law), une île artificielle flottante située dans la baie de Tokyo plus communément appelée "District 24". Nous allons y suivre le quotidien de trois amis d'enfance nés et élevés sur l'île : Ran, Koki et Shûta. Même s'ils proviennent de différentes classes sociales et qu'ils ont tous les trois des personnalités et des hobbies différents, ils traînent toujours ensemble. Cependant, leurs relations vont radicalement changer après un certain incident.Lors d'une cérémonie commémorative, un an après l'incident, les trois amis se retrouvent et leurs téléphones se mettent à sonner en même temps. L'appel provient d'un ami qu'ils croyaient mort et qui les oblige à faire un choix qui s'apprête à changer radicalement leurs vies...Chacun d'entre eux devra protéger l'avenir des habitants du District 24 de la façon qu'il juge juste.

Nous sommes en 972 après J.-C. à Kyoto, la capitale de l'ancien Japon. Kyoto devient une ville corrompue et délabrée ; les samouraïs égoïstes et les onmyoji, qui ne se soucient que d'accéder au pouvoir politique, sont partout. Pour aggraver les choses, la ville souffre de famine et de maladies généralisées. Incapable d'ignorer plus longtemps l'état de la ville, la cour impériale décide d'envoyer Minamoto no Raiko, un célèbre samouraï bien connu pour ses talents de tir à l'arc, pour récupérer un joyau légendaire censé détenir le pouvoir mystérieux de sauver le monde. Cependant, Raiko tombe également malade. Au lieu de cela, sa plus jeune sœur, Hikaru, décide secrètement de faire le voyage à sa place. Hikaru rencontre de nombreuses personnes et vit de nombreuses aventures lors de son voyage pour le joyau légendaire.

Sasaki Yukinari est un jeune garçon petit pour son âge et donc maltraité et brutalisé par beaucoup de filles. Avec le temps, il a développé une véritable phobie des filles, si bien qu'il en est désormais allergique, dès qu'une fille le touche, des boutons envahissent son corp.Un jour, Yukinari est transporté dans la ville de Seiren dans un autre monde invisible de la Terre. Il fait la connaissance de Miharu-chan qui à sa grande surprise ne déclenche aucun allergie en lui. Cependant la ville de Seiren est peuplée pratiquement que de filles, les hommes sont très rare, et toutes les filles de la ville commencent à courir après le pauvre Yukinari...

Tout est dit dans le titre et pourtant si peu. Un désert, une ville recluse. Un type genre pistolero, tout de noir vêtu, traîne ses longues jambes flegmatiques... C'est Van.Van est la personne qui peut en surprendre plus d'un. Quand il débarque dans l'église pour demander son chemin et qu'il voit une petite fille se faire descendre, on s'attend à ce qu'il s'énerve. Même pas ! Il s'excuse. L'antihéros par excellence. Il prend à contre-pied l'audience. Par contre quand sa vie est menacée, c'est une autre affaire...Ce héros n'est pas normal. Rien qu'à la manière dont il se bat par exemple ! Mais bien d'autres preuves pointent leur nez à mesure qu'avance l'intrigue...Dans un univers où la lame en découd avec l'arme à feu, où les chevaux côtoient les méchas, Van poursuit sa recherche de l'Homme aux Serres de Fer.

À cause du travail de ses parents, Yu Narukami emménage chez son oncle, dans la ville rurale d'Inaba. Sur place, Yu se fait à sa nouvelle vie et sympathise avec Yosuke Hanamura et Chie Satonaka. Mais le jour même de sa rentrée, en seconde année de lycée, un mystérieux évènement frappe Inaba : le corps d'une journaliste est découvert, suspendu à une antenne. Peu après, Yu découvre l'existence de la Mayonaka TV, un phénomène qui consisterait à voir apparaître le visage de son âme-sœur en fixant son écran de télévision, à minuit, un soir de pluie. Yu s'essaie au phénomène et voit apparaître le visage d'une lycéenne. Le lendemain, un nouvel évènement frappe Inaba, et Yu se rend compte que les personnes apparaissant dans la Mayonaka TV meurent peu de temps après leur apparition. Et s'il y avait un lien entre cette série de meurtre et le monde parallèle qui se trouve derrière les écrans de télé ?

The Exodite suit la lutte d'une force expéditionnaire de l'Empire T'au pour apporter le Bien Suprême sur une nouvelle planète. Cependant, il y a de nombreux opposants à cette notion, prêts à prendre position.